Date オブジェクトのミリ秒の部分を設定します。引数 numMilli に 999 を超える値か負の値を指定すると、値に応じて格納されている秒 (場合によっては分、時) の値が変更されます。
var d = new Date(); d.setMilliseconds(99); // 99ミリ秒を設定